Csapadékos őszi időjárásban vagy öntözés esetén előfordul, hogy az érés elhúzódik, és a gyomok olyan mennyiségben jelennek meg, ami a betakarítást gátolja. Ilyen esetekben alkalmazható a deszikkálás.
A szója betakarítását akkor lehet megkezdeni, amikor a csúcsi fürt hüvelyében a magvak teljesen kifejlődtek, a levelek már mind lehullottak, és a csúcsi magok is a fajtára jellemzően elszíneződtek. A szójamag ebben az állapotban 13-18% vizet tartalmaz.
A legkisebb veszteséggel és a magok legcsekélyebb sérülésével a 16-18 %-os víztartalmú szója takarítható be.
A 12 %-os nedvességtartalom alatti (túlérett) szójában nő a betakarítási veszteség és a magsérülés.
